Las piezas expuestas constituyen una interesante muestra del rico y singular patrimonio navarro.
La colección abarca una cronología que va desde la Prehistoria hasta el siglo XX.
Constituyen bienes de relevancia internacional: el mapa magdaleniense de Abauntz, la arqueta hispano-musulmana de Leire, los capiteles románicos del claustro de la primitiva Catedral de Pamplona, la colección de pintura mural gótica de Navarra, con especial mención a la procedente del citado conjunto catedralicio y el retrato del Marqués de San Adrián realizado por Goya.
Además ofrece un amplio programa cultural que se desarrolla en su sala de exposiciones temporales, salón de actos, talleres didácticos, etc. Posee una biblioteca - mediateca especializada y un Fondo Documental de Artistas Navarros Contemporáneos.